MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 chromosome

Total Repeats: 71084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014650	TGG	2	6	421	426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312109152
2	NC_014650	GAAAA	2	10	468	477	80 %	0 %	20 %	0 %	312109152
3	NC_014650	CAA	2	6	511	516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312109152
4	NC_014650	GA	3	6	572	577	50 %	0 %	50 %	0 %	312109152
5	NC_014650	ATT	2	6	657	662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109152
6	NC_014650	CCT	2	6	663	668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312109152
7	NC_014650	AATC	2	8	669	676	50 %	25 %	0 %	25 %	312109152
8	NC_014650	GAT	2	6	681	686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109152
9	NC_014650	AGC	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312109152
10	NC_014650	TATT	2	8	868	875	25 %	75 %	0 %	0 %	312109152
11	NC_014650	CGG	2	6	878	883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312109152
12	NC_014650	ATGC	2	8	909	916	25 %	25 %	25 %	25 %	312109152
13	NC_014650	TCCG	2	8	944	951	0 %	25 %	25 %	50 %	312109152
14	NC_014650	AGT	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109152
15	NC_014650	TATC	2	8	963	970	25 %	50 %	0 %	25 %	312109152
16	NC_014650	TTA	2	6	994	999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109152
17	NC_014650	CAA	2	6	1034	1039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312109152
18	NC_014650	CTA	2	6	1059	1064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312109152
19	NC_014650	TGA	2	6	1067	1072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109152
20	NC_014650	AAG	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109152
21	NC_014650	CA	3	6	1119	1124	50 %	0 %	0 %	50 %	312109152
22	NC_014650	GAA	2	6	1140	1145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109152
23	NC_014650	CAAA	2	8	1148	1155	75 %	0 %	0 %	25 %	312109152
24	NC_014650	GCC	2	6	1175	1180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312109152
25	NC_014650	CTC	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312109152
26	NC_014650	A	7	7	1286	1292	100 %	0 %	0 %	0 %	312109152
27	NC_014650	CGT	2	6	1391	1396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109152
28	NC_014650	TCA	2	6	1404	1409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312109152
29	NC_014650	ATT	2	6	1461	1466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109152
30	NC_014650	AAGAA	2	10	1557	1566	80 %	0 %	20 %	0 %	312109152
31	NC_014650	TCAT	2	8	1678	1685	25 %	50 %	0 %	25 %	312109152
32	NC_014650	A	6	6	1693	1698	100 %	0 %	0 %	0 %	312109152
33	NC_014650	ATCG	2	8	1969	1976	25 %	25 %	25 %	25 %	312109153
34	NC_014650	ACT	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312109153
35	NC_014650	GCA	2	6	2174	2179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312109153
36	NC_014650	TGC	2	6	2183	2188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109153
37	NC_014650	T	7	7	2197	2203	0 %	100 %	0 %	0 %	312109153
38	NC_014650	A	7	7	2214	2220	100 %	0 %	0 %	0 %	312109153
39	NC_014650	GAA	2	6	2317	2322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109153
40	NC_014650	CCGTTT	2	12	2411	2422	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312109153
41	NC_014650	ACAG	2	8	2491	2498	50 %	0 %	25 %	25 %	312109153
42	NC_014650	GTC	2	6	2557	2562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109153
43	NC_014650	TTA	2	6	2630	2635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109153
44	NC_014650	AAAAC	2	10	2656	2665	80 %	0 %	0 %	20 %	312109153
45	NC_014650	TAT	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109153
46	NC_014650	TCT	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312109153
47	NC_014650	GCTT	2	8	2684	2691	0 %	50 %	25 %	25 %	312109153
48	NC_014650	CTT	2	6	2789	2794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312109153
49	NC_014650	GA	3	6	2802	2807	50 %	0 %	50 %	0 %	312109153
50	NC_014650	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109153
51	NC_014650	TGT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312109153
52	NC_014650	ACG	2	6	2833	2838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312109153
53	NC_014650	CAT	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312109153
54	NC_014650	TCC	2	6	2863	2868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312109153
55	NC_014650	GGA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312109153
56	NC_014650	TTTC	2	8	2939	2946	0 %	75 %	0 %	25 %	312109153
57	NC_014650	AT	3	6	2955	2960	50 %	50 %	0 %	0 %	312109153
58	NC_014650	ATGG	2	8	3193	3200	25 %	25 %	50 %	0 %	312109154
59	NC_014650	A	6	6	3203	3208	100 %	0 %	0 %	0 %	312109154
60	NC_014650	GCG	2	6	3276	3281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312109154
61	NC_014650	CAAA	2	8	3299	3306	75 %	0 %	0 %	25 %	312109154
62	NC_014650	CGC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312109154
63	NC_014650	A	6	6	3355	3360	100 %	0 %	0 %	0 %	312109154
64	NC_014650	AGTCGA	2	12	3370	3381	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312109154
65	NC_014650	GTT	2	6	3429	3434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312109155
66	NC_014650	A	6	6	3453	3458	100 %	0 %	0 %	0 %	312109155
67	NC_014650	ATT	2	6	3508	3513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109155
68	NC_014650	GA	3	6	3518	3523	50 %	0 %	50 %	0 %	312109155
69	NC_014650	ATG	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109155
70	NC_014650	GAAG	2	8	3640	3647	50 %	0 %	50 %	0 %	312109155
71	NC_014650	CAA	3	9	3650	3658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312109155
72	NC_014650	ATT	2	6	3685	3690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109155
73	NC_014650	A	6	6	3694	3699	100 %	0 %	0 %	0 %	312109155
74	NC_014650	A	6	6	3702	3707	100 %	0 %	0 %	0 %	312109155
75	NC_014650	AGC	3	9	3728	3736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312109155
76	NC_014650	TA	3	6	3865	3870	50 %	50 %	0 %	0 %	312109155
77	NC_014650	GCA	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312109155
78	NC_014650	ATT	2	6	3914	3919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109155
79	NC_014650	TGC	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109155
80	NC_014650	CG	3	6	3935	3940	0 %	0 %	50 %	50 %	312109155
81	NC_014650	AGC	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312109155
82	NC_014650	TTTTGC	2	12	4025	4036	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312109155
83	NC_014650	AAT	2	6	4146	4151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312109155
84	NC_014650	AG	3	6	4185	4190	50 %	0 %	50 %	0 %	312109155
85	NC_014650	ACA	2	6	4287	4292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312109155
86	NC_014650	AAC	2	6	4296	4301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312109155
87	NC_014650	AATT	2	8	4331	4338	50 %	50 %	0 %	0 %	312109155
88	NC_014650	T	6	6	4337	4342	0 %	100 %	0 %	0 %	312109155
89	NC_014650	TGA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109155
90	NC_014650	CAT	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312109155
91	NC_014650	AGC	2	6	4500	4505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312109155
92	NC_014650	ATG	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109156
93	NC_014650	CAT	2	6	4716	4721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312109156
94	NC_014650	TGA	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109156
95	NC_014650	GCA	2	6	4807	4812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312109156
96	NC_014650	AGG	2	6	4907	4912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312109156
97	NC_014650	TGGCGG	2	12	4919	4930	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	312109156
98	NC_014650	CGT	2	6	4970	4975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109156
99	NC_014650	GAA	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109156
100	NC_014650	GCG	2	6	5047	5052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312109156
101	NC_014650	T	6	6	5192	5197	0 %	100 %	0 %	0 %	312109156
102	NC_014650	A	6	6	5246	5251	100 %	0 %	0 %	0 %	312109156
103	NC_014650	GAG	2	6	5322	5327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312109156
104	NC_014650	ATT	2	6	5337	5342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109156
105	NC_014650	AGC	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312109156
106	NC_014650	AAC	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312109156
107	NC_014650	AC	3	6	5433	5438	50 %	0 %	0 %	50 %	312109156
108	NC_014650	ATT	2	6	5484	5489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109156
109	NC_014650	ACGC	2	8	5497	5504	25 %	0 %	25 %	50 %	312109156
110	NC_014650	ACA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312109156
111	NC_014650	ACAA	2	8	5612	5619	75 %	0 %	0 %	25 %	312109156
112	NC_014650	ACGG	2	8	5645	5652	25 %	0 %	50 %	25 %	312109156
113	NC_014650	TTG	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312109156
114	NC_014650	GAT	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109156
115	NC_014650	GGC	2	6	5741	5746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312109156
116	NC_014650	GC	3	6	5751	5756	0 %	0 %	50 %	50 %	312109156
117	NC_014650	GGC	2	6	5759	5764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312109156
118	NC_014650	A	6	6	5766	5771	100 %	0 %	0 %	0 %	312109156
119	NC_014650	GC	3	6	5797	5802	0 %	0 %	50 %	50 %	312109156
120	NC_014650	TCC	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312109156
121	NC_014650	ATT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109156
122	NC_014650	CAA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312109156
123	NC_014650	ATT	2	6	6018	6023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109156
124	NC_014650	GC	3	6	6069	6074	0 %	0 %	50 %	50 %	312109156
125	NC_014650	ATT	2	6	6087	6092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109156
126	NC_014650	ATT	2	6	6131	6136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109156
127	NC_014650	CTTT	2	8	6142	6149	0 %	75 %	0 %	25 %	312109156
128	NC_014650	CCG	2	6	6201	6206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312109156
129	NC_014650	ACAA	2	8	6226	6233	75 %	0 %	0 %	25 %	312109156
130	NC_014650	A	6	6	6265	6270	100 %	0 %	0 %	0 %	312109156
131	NC_014650	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312109156
132	NC_014650	AAC	2	6	6356	6361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312109156
133	NC_014650	GCT	2	6	6383	6388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109156
134	NC_014650	AAG	2	6	6461	6466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109156
135	NC_014650	GAA	2	6	6477	6482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109156
136	NC_014650	CGC	2	6	6715	6720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312109157
137	NC_014650	TCG	2	6	6785	6790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109157
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139	NC_014650	CGG	2	6	6827	6832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312109157
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154	NC_014650	TGCAA	2	10	7548	7557	40 %	20 %	20 %	20 %	312109157
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254	NC_014650	AT	3	6	18045	18050	50 %	50 %	0 %	0 %	312109160
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264	NC_014650	A	6	6	18306	18311	100 %	0 %	0 %	0 %	312109160
265	NC_014650	GGT	2	6	18384	18389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312109160
266	NC_014650	AGA	2	6	18428	18433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109160
267	NC_014650	CTATT	2	10	18527	18536	20 %	60 %	0 %	20 %	312109160
268	NC_014650	TAA	2	6	18540	18545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312109160
269	NC_014650	A	6	6	18661	18666	100 %	0 %	0 %	0 %	312109161
270	NC_014650	ATT	2	6	18672	18677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109161
271	NC_014650	TGA	2	6	18682	18687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109161
272	NC_014650	GCG	2	6	18762	18767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312109161
273	NC_014650	A	7	7	18805	18811	100 %	0 %	0 %	0 %	312109161
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276	NC_014650	TGC	2	6	19037	19042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109161
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280	NC_014650	TTG	2	6	19257	19262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312109161
281	NC_014650	GAT	2	6	19326	19331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109161
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288	NC_014650	A	6	6	19578	19583	100 %	0 %	0 %	0 %	312109161
289	NC_014650	AGT	2	6	19628	19633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109161
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292	NC_014650	A	7	7	19705	19711	100 %	0 %	0 %	0 %	312109161
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297	NC_014650	CGG	2	6	19937	19942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312109161
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392	NC_014650	TTTC	2	8	24738	24745	0 %	75 %	0 %	25 %	312109166
393	NC_014650	T	6	6	24937	24942	0 %	100 %	0 %	0 %	312109167
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395	NC_014650	TGC	2	6	25194	25199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109167
396	NC_014650	CAT	2	6	25274	25279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312109167
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402	NC_014650	GTT	2	6	25623	25628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312109167
403	NC_014650	CAT	2	6	25724	25729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312109167
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500	NC_014650	CGG	2	6	36378	36383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312109174

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